スタディープラスとスタグインとさぼろだと思います。
わたしは、全部試しましたが、スタディープラスが一番使いやすいです！

んー、Googleとかで「勉強記録アプリ」とか検索すれば出ると思いますが…
私的には、普通のタイマーを使ったほうが勉強は集中しやすいですよ

スタディプラスがそうですよ。
教材なんかも記録できます。